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我正在设计一个字符串算法,问题在于输入的大小.根据定义, Java的最大字符串长度为2147483647,以避免混淆~2.15×10 ^ 9.

根据定义,Manacher的算法需要一个字符数组：

char [n * 2 3]其中n是输入的长度(大小为n的字符串)

根据定义,最大整数是上面提到的~2.15×10 ^ 9,因此字符数组可以是最大尺寸

char [ ~2.15x10^9 ];

这种java中的管理算法计算,将输入字符串的限制降低到n =(~2.15×10 ^ 9 – 3)/ 2.准确到那就是1073741822.~1.1×10 ^ 9.

最大长度的字符数组有(n * 2)32字节=(~2.1×10 ^ 9 * 2)32字节= ~4.2×10 ^ 9字节(4.2GBs)

还有各种大小,集合和其他集合的附加阵列.我相信这将使该程序占用~~ 30GB的整个空间.用于RAM存储器的最大输入,用于计算我们识别为最多约1.1×10 ^ 9个字符的算法.

你能否告诉我一些技术,以便在“最长的字符串输入”和“内存管理”之间保持平衡？谢谢

最佳答案 根据 this article,Manacher算法在线性时间内找到最长的回文子串(n是原始字符串的长度).

Here’s an implementation in Java,它表明该算法在内存消耗方面也相当不错(你需要两个数组,一个字符和一个整数,两个都是原始字符串的两倍,你还需要存储原始字符串).

问题是您的原始字符串非常长,因此您达到语言限制,内存限制等.

另一方面,您的字母表只包含7个字符：您的原始字符串字符A C T G,加上字母分隔符(例如#)以及字符串字符的开头和结尾(例如$和@).这意味着您只需要3位来存储每个可能的字符.因此,如果您愿意使用按位运算符和位掩码,则可以在长整数中存储21个字符(这是因为long用64位表示).这种方法对代码来说会更复杂,但它会使用更少的内存.

另一种可能的解决方案是使用动态结构而不是字符串和数组.这些结构将使用相当大的内存,但它不会是连续的内存,这意味着你不会达到最大数组大小限制和int的语言限制等.这种方法使用suffix tree,根据this article,它是线性的时间方法.在那篇文章中,有一个C语言的解决方案.祝好运！