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一、系统环境的配置：

Windows 7 64bit

Eclipse 3.7

R 2.15

rJava 0.9-3

二、 整合的步骤列表：

2.1    在R里安装rJava扩展包。JRI已经被包含在rJava里了。命令是: install.packages(“rJava”)。运行完成后rJava默认被安装在R的安装路径，如：C:\Program Files\R\R-XXXXXX\library\rJava。

2.2    打开JRI的安装目录，如：C:\Program Files\R\R-XXXXXX\library\rJava\jri，即可看到从Java里调用时需要使用的文件和目录。其中: examples中包含示例Java源文件，可以用来测试你的设置是否正确。jri.dll是需要使用的动态链接库，运行Java程序时会被用到。JRI.jar以及另两个jar文件是Java类库，编译Java源文件时需要用到。

2.3      我们现在在Eclipse里新建一个Java项目，然后把examples目录里的.java文件复制到这个项目里。

2.4    设置运行环境。

2.4.1    首先使Java类能够编译。需要把上面提到的三个jar文件加到项目的类路径里。右键点击项目名，选择Properties，然后在左侧边栏中选择Java Build Path，然后在右侧tab里选择Libraries，然后选择Add External JARs…，在弹出的选择框里选择jri文件夹里的三个.jar文件，点确定。这时，这三个新文件应该会在界面上被列出来。点击OK退出项目属性界面后，Java类应该会被重新编译，所有文件应该能被编译通过了。

2.4.2    配置运行时的动态链接库。主要是两步：首先，包含jri.dll的文件夹必须在java.library.path里；其次，R.dll必须在运行路径下。在Eclipse项目里，右键点击rtest.java，在弹出菜单里选择”Run As…”，然后选择”Run Configurations …”，这时会出现对话框。在右边列出的tab中，选择Arguments这个tab，在VM Arguments里加入一行：-Djava.library.path=”C:\Program Files\R\R-XXXXXX\library\rJava\jri\x64”。然后tab里选择Environment，按New添加新变量，变量名为PATH，值是C:\Program Files\R\R-XXXXXX\bin\x64。配置Arguments的界面：

2.5    完成上一步后，运行刚才新建的配置即可。运行时的界面如下：